El mejor software de facturación para autónomos en 2026: 9 herramientas comparadas

El mejor software de facturación para la mayoría de autónomos es Wave o Zoho Invoice si quieres no pagar nada, FreshBooks si quieres una facturación cuidada con control de tiempo y estás dispuesto a pagar por ello, y Bonsai o HoneyBook si quieres propuestas, contratos y facturas en un solo lugar. QuickBooks y Xero tienen sentido cuando tu gestor ya trabaja con ellos. Invoice Ninja es para quien quiere alojarlo en su propio servidor, y Stripe Invoicing para desarrolladores o para quien solo necesita una factura cobrable sin cuota mensual. Los precios que se indican a continuación son de octubre de 2026.

El software de facturación de un vistazo

Cómo comparamos

Comparamos las funciones, planes y precios publicados en la web oficial de cada proveedor a octubre de 2026. No hicimos pruebas prácticas. Los precios están en dólares estadounidenses, tal como se muestran en las páginas de EE. UU., sin impuestos. Varios proveedores tienen descuentos de lanzamiento; indicamos el precio normal y mencionamos la promoción cuando la página la mostraba, porque el precio normal es lo que pagas después de los primeros meses. Dejamos fuera todo lo que no pudimos confirmar en la web del proveedor, incluidas las tarifas de procesamiento de tarjetas de las herramientas que no las publicaban en su página de precios.

Lo que más importa a un autónomo:

• Límites del plan gratuito: facturas al mes o al año, número de clientes.
• Cobrar: si los clientes pueden pagar online con tarjeta o transferencia, y cuánto cuesta.
• Extras: control de tiempo, gastos, propuestas y contratos.
• Quién más necesita acceso: tu gestor o un colaborador.

Wave: facturación y contabilidad básica gratuitas

Wave es la opción gratuita más generosa si también necesitas una contabilidad básica.

• Starter (0 $): presupuestos, facturas, facturas de proveedor y registros contables ilimitados, además de una aplicación móvil para facturar sobre la marcha. Los pagos online son opcionales y están sujetos a comprobaciones de elegibilidad.
• Pro: 19 $/mes o 190 $/año.
• Comisiones con tarjeta: en Starter, 2,9 % + 0,60 $ por cada pago con tarjeta y 3,4 % + 0,60 $ para Amex. Pro elimina los 0,60 $ en las primeras 10 operaciones con tarjeta de cada mes.
• Límites: los 0,60 $ fijos por cada pago con tarjeta se acumulan en facturas pequeñas.
• Elígela si quieres facturación gratuita y una contabilidad sencilla en un mismo sitio.

Zoho Invoice: gratis, con límites claros

Zoho Invoice se presenta como una herramienta de facturación gratuita para siempre.

• Free: hasta dos usuarios, tres proyectos, 500 facturas al año y dos organizaciones por cuenta de Zoho.
• Límites: las facturas llevan la marca «Powered by Zoho Invoice» y no hay planes de pago publicados. Si te quedas pequeño, Zoho te remite a Zoho Billing o a su equipo comercial.
• Elígela si facturas a menos de unos 40 clientes al mes y no necesitas contabilidad completa en la misma herramienta.

FreshBooks: facturación cuidada para trabajos de servicios

FreshBooks está pensada para facturar servicios, con control de tiempo y gastos a la vez.

• Lite: 23 $/mes, hasta 5 clientes facturables.
• Plus: 43 $/mes, hasta 50 clientes facturables.
• Premium: 70 $/mes, clientes facturables ilimitados. Select es a medida.
• Promoción: la página mostraba un 80 % de descuento en los planes mensuales durante los 4 primeros meses, y una prueba gratuita de 30 días sin tarjeta.
• Límites: no hay plan gratuito, y los límites de clientes importan. El límite de 5 clientes de Lite es muy justo para quien tiene muchos clientes pequeños.
• Elígela si facturas a unos pocos clientes habituales por tiempo y quieres facturas con aspecto profesional con poca configuración.

QuickBooks: cuando tu gestor lo usa

QuickBooks Online es un software de contabilidad completo. Muchos gestores ya trabajan con él.

• Free: 0 $, un usuario, seguimiento de ingresos y gastos, tres informes y una cuenta bancaria. Hasta dos facturas al mes, o ilimitadas si cumples los requisitos para activar QuickBooks Payments. Sin aplicación móvil, integraciones ni acceso para el gestor.
• Simple Start: 38 $/mes en tarifa de lista, un usuario; la página mostraba un 50 % de descuento durante los tres primeros meses. Essentials cuesta 85 $, Plus 140 $ y Advanced 340 $.
• Límites: es más software del que necesita un autónomo que solo factura, y el precio sube rápido cuando termina el descuento.
• Elígelo si tu gestor lo pide, o si quieres facturación y libros listos para la declaración en una sola herramienta.

Xero: contabilidad que facilita el trabajo al gestor

Xero es un software de contabilidad muy valorado por los gestores.

• Early: 27 $/mes, incluye presupuestos, 20 facturas y 5 facturas de proveedor.
• Growing: 59 $/mes. Established: 97 $/mes.
• Promoción: 90 % de descuento sobre la suscripción base durante los seis primeros meses para nuevos clientes de EE. UU., hasta el 2 de noviembre de 2026.
• Límites: 20 facturas al mes en Early bastan para unos pocos clientes con iguala, pero no para trabajos pequeños de alto volumen.
• Elígelo si quieres una contabilidad en toda regla y tu gestor prefiere Xero.

Bonsai: todo el flujo de trabajo del autónomo

Bonsai reúne herramientas de trabajo con clientes: propuestas, contratos, facturas, control de tiempo y un portal de cliente.

• Basic: 15 $/mes (9 $ con facturación anual), pero no incluye facturación.
• Essentials: 25 $/mes o 19 $/mes con facturación anual por usuario, con facturas y pagos, propuestas, contratos, formularios, programación, portal de cliente y control de gastos.
• Premium (39 $, o 29 $ al año) y Elite (59 $, o 49 $ al año): añaden informes, integraciones con QuickBooks, Xero y Zapier, y quitar la marca de Bonsai.
• Límites: prueba de 7 días y, después, necesitas un plan de pago. Para quitar la marca de Bonsai hace falta Premium.
• Elígela si envías una propuesta y un contrato antes de cada factura y quieres una sola herramienta para todo.

HoneyBook: para negocios creativos

HoneyBook es una plataforma de gestión de clientes muy popular entre fotógrafos, organizadores de eventos y otros negocios creativos de servicios.

• Starter: 29 $/mes con facturación anual, con clientes y proyectos ilimitados, facturas y pagos, propuestas y contratos, portal de cliente y hasta 2 formularios de contacto activos.
• Essentials: 49 $/mes con facturación anual, que añade planificador, automatizaciones, la integración con QuickBooks Online y hasta 2 miembros del equipo.
• Premium: 109 $/mes con facturación anual.
• Prueba: las preguntas frecuentes indican que puedes probarla gratis durante 30 días sin tarjeta.
• Límites: es más que una herramienta de facturación, y su precio lo refleja. La página no mostraba con claridad los precios con facturación mensual.
• Elígela si gestionas reservas, contratos y señales para eventos o sesiones.

Invoice Ninja: barata, y puedes alojarla tú

Invoice Ninja ofrece un servicio alojado y una versión que ejecutas en tu propio servidor.

• Free (alojado): hasta 5 clientes, facturación ilimitada.
• Ninja Pro: 14 $/mes o 140 $/año. Enterprise: desde 18 $/mes para 1 o 2 usuarios.
• Autoalojado: el repositorio oficial lo describe como código disponible bajo la Elastic License, con todas las funciones Pro y Enterprise incluidas. Quitar la marca de Invoice Ninja cuesta 40 $ al año.
• Límites: autoalojarlo significa que tú te encargas del servidor, las actualizaciones y las copias de seguridad.
• Elígela si quieres controlar tus datos o el precio de pago más bajo de esta lista.

Stripe Invoicing: sin cuota mensual

Stripe Invoicing te permite enviar facturas que los clientes pagan online a través de Stripe.

• Starter: 0,4 % por factura pagada. Plus: 0,5 % por factura pagada, incluidos los presupuestos.
• Stripe indica que no hay cuotas fijas ni costes de alta, pero se aplican encima las comisiones habituales de procesamiento de pagos de Stripe.
• Límites: es una herramienta de facturación y cobros, no de contabilidad. Seguirás necesitando un lugar donde llevar los gastos y los impuestos.
• Elígela si ya usas Stripe, o si facturas poco y no quieres una suscripción. Nuestra guía de Stripe frente a PayPal cubre la parte de los pagos.

Cuándo tiene más sentido una herramienta de facturación a medida

Las herramientas estándar encajan bien con la facturación habitual de un autónomo. Encajan peor cuando tu facturación tiene reglas propias: un traductor que cobra por palabra y par de idiomas, un contratista que elabora presupuestos a partir de una lista de piezas, un profesor particular que factura a las familias en paquetes de sesiones, o una pequeña agencia que quiere que sus clientes entren y vean cada proyecto, presupuesto y factura en un portal.

Ahí una pequeña app propia puede ser mejor. Con Mythex describes la herramienta en el chat, por ejemplo «clientes, un generador de presupuestos que cobre por palabra, convertir un presupuesto en factura y una página donde el cliente vea lo que debe», y la IA la construye con vista previa en vivo. Añade base de datos, inicio de sesión y almacenamiento de archivos cuando la app lo necesita, y la publicas en una URL con un clic. El plan Free da 5 créditos al día; Pro empieza en 25 $ al mes e incluye exportación de código y GitHub. Para un flujo centrado en presupuestos, consulta el generador de presupuestos, y nuestra guía paso a paso sobre cómo crear una app de facturación.

La contrapartida, dicha claramente: una herramienta a medida no trae conexión con el banco, informes fiscales ni un gestor que ya la conozca. Aceptar pagos con tarjeta implica conectar tú un proveedor como Stripe (consulta cómo añadir pagos a tu app). Para la mayoría de autónomos, Wave, Zoho Invoice o FreshBooks son la respuesta más rápida. Crea la tuya cuando la forma de poner precios o de presentar el trabajo sea lo que las herramientas estándar no pueden hacer. Nuestra guía sobre construir o comprar software para pequeñas empresas profundiza en esa decisión.

Para quién es cada una

• No pagar nada y también llevar contabilidad: Wave.
• No pagar nada, solo facturas: Zoho Invoice.
• Pocos clientes y facturación por tiempo: FreshBooks.
• Lo elige tu gestor: QuickBooks o Xero.
• Propuestas y contratos primero: Bonsai o HoneyBook.
• Autoalojamiento o el precio de pago más bajo: Invoice Ninja.
• Sin suscripción y ya usas Stripe: Stripe Invoicing.
• Precios poco habituales o portal de cliente: una herramienta a medida.

Veredicto

Empieza gratis con Wave o Zoho Invoice, y paga solo cuando alcances un límite real. FreshBooks es la opción de pago más centrada en la facturación, pero vigila sus límites de clientes. QuickBooks y Xero merecen la pena cuando quieras una contabilidad completa, sobre todo si tu gestor usa una de ellas. Bonsai y HoneyBook solo compensan su precio si vas a usar también los contratos y las propuestas. Revisa el precio normal, no el descuento de los primeros meses, y suma las comisiones de tarjeta sobre una factura típica antes de decidir. Si estás montando una actividad como autónomo desde cero, nuestra guía sobre cómo crear un negocio de consultoría cubre el resto.

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